购买车辆时，合格证不能当时拿到的原因可能有以下几点：

1. 合格证是车企发给经销商（即卖车方）的票据，由经销商进行保管，因此购车者在购车时可能无法直接拿到合格证。这种情况下，合格证通常会在车辆完成相关手续后交给车主。

2. 如果是在贷款购车的情况下，合格证可能会作为贷款的抵押物，在还清贷款后才能取回。这是因为银行或金融机构需要一些额外的担保来降低风险，而合格证是他们认为具有价值且易于管理的担保物。此外，某些情况下，合格证也可能需要经过一系列程序，如检验等才能到手。这也是为了保证销售的车辆都符合相关标准和规定。所以有时车主提车后可能次日才能拿到合格证。如果是这种情况的话，只要等待一段时间，根据商家提供的办理流程跟进进度即可。若迟迟未拿到合格证，可以咨询工作人员获得及时有效的解决方案。

总的来说，购买车辆时未能立即拿到合格证是正常现象，车主无需过分担心。不过为了确保自身权益不受损害，一定要保留好购车凭证等相关材料。另外需注意核对并保存合格证信息等重要细节，确保万无一失。如果长时间未拿到合格证，建议咨询卖车方并寻求合理解决方案。