机动车合格证编号可以通过以下途径查询：

1. 汽车合格证电子证书查询系统查询：输入车辆合格证编号和车辆识别代号后六位数字进行查询，可以直接获得汽车合格证的信息。用户可以多次查询输入相关信息以验证车辆的型号及合法性。可以通过搜索引擎查询当地的车辆合格证电子证书查询系统网站。

2. 车辆合格证查询网站查询：车辆合格证编号可以通过车辆合格证查询网站进行查询。在网站上输入车辆的相关信息，如品牌、车型等，可以找到车辆合格证的编号。此外，车辆合格证上的二维码也可以扫描获取车辆的相关信息。这种方法适用于车主个人查询。另外还有一种方法是向经销商咨询或查询监管机构。您可以在购买车辆的经销商处询问，并出示您的购买凭证等相关证明文件，让他们帮您查找合格证编号。也可以联系当地的汽车质量监督机构或交通管理部门咨询车辆合格证查询的相关事宜。请注意在进行车辆购买或登记前一定要核实车辆合格证的真伪和有效性。

以上信息仅供参考，建议咨询当地车管所工作人员获取更准确的信息。